明朝，甘肃归陕西布政司管辖，说“陕甘一家”即由此开始。明初，都城远在南京，北遁的鞑靼、瓦剌等势力时常袭扰西北边境。朱元璋采纳朱升“高筑墙，广积粮”的建议，开始在西北实施设军镇、筑边墙、建关隘和屯田戍边的战略防御政策。自朱元璋开始至嘉靖皇帝，逐步加强完善西北边防，形成东起鸭绿江，西抵嘉峪关，自东而西，绵延万里的北部边防线，相继设立了辽东镇、蓟州镇、宣府镇、大同镇、偏头镇（太原镇或山西镇）、延绥镇、宁夏镇、固原镇、甘肃镇九个边防重镇，史称“九边重镇”。甘肃镇位于最西端，其“夹以一线之路，孤悬两千里，西控西域，南隔羌戎，北遮胡虏”，“近而藩垣四镇，远而纲领九边，通玉帛于天方，列毡庐于疆场，黄河、黑水、昆仑、崆峒际天极地，巍然一大镇也”。甘肃镇内外复杂的民族关系，使其在九边中更具特殊的军事和政治地位。

洪武二十四年（1391年），出于御边需要，朱元璋将汉王朱楧改封为肃王，命其就藩甘肃镇。同年，陕西行都指挥使司指挥宋晟扩建甘州城，修建肃王府。洪武二十六年（1393年），陕西行都指挥使司自庄浪徙治甘州，领甘州左、右、中、前、后五卫及肃州、山丹、永昌、凉州、镇蕃、庄浪、西宁七卫计十二卫，以及高台、镇夷、古浪、碾伯（后废）四守御千户所，并赤斤蒙古、沙州、哈密、安定、罕东、曲先、苦峪六羁縻卫所，以控制边境。同年正月，因甘州肃王府尚在修建，肃王奉诏先暂住平凉。洪武二十七年（1394年），李景隆出任平羌将军，镇守甘州。洪武二十八年（1395年），肃王正式入驻甘州。根据朱元璋的诏令，肃王就藩甘州除直接掌控王府甘州三护卫军外，陕西行都指挥使司甘州五卫军务全部听从肃王调派。也就是说，肃王当时不仅有藩王的头衔，更兼有都司镇守、总兵的双重身份，总掌甘肃镇兵权，足见明太祖对肃王朱楧的高度信任。建文元年（1399年），因建文帝畏惧藩王起事，采取削藩政策，在李景隆的双面操纵下，肃王因此放弃兵权，徙居黄河以东的临洮府兰县（今甘肃兰州），退出军事区，表示自己没有反心，以保全自己和家人。当时，肃王只带着护卫肃王府的甘州右卫和甘州中卫移徙兰县。同年，宋晟第二次进驻甘州，镇守甘肃镇。永乐八年（1410年），西宁侯宋琥继其父业，镇守甘肃。万历二年（1574年），甘肃巡抚石茂华经请示朝廷同意，用青砖包砌甘州城墙。

有明一朝通过在北方实施设军镇、筑边墙、造城堡、建关隘、置烽燧，大力推行战略防御政策。张掖境内的明长城主要修筑于嘉靖、隆庆和万历年间，从市境东南进入，依次经山丹县、甘州区、临泽县、高台县绵延至酒泉市金塔县，总体沿河西走廊北侧合黎山脉的龙首山、东大山、马鬃山、大青山、盘头山、黑山西南麓，及巴丹吉林沙漠南缘向西北延伸，中途穿越戈壁荒滩、沙漠盐沼、湿地林带、山地沟壑、耕地村庄，全线长550余千米。如今，山丹县境内长270余千米的汉明长城并行的壮观景象，已然成为一条独特的风景线。除修建边墙外，明朝还在甘州城的东北隅修建了甘肃仓、预备仓和草场，在西南隅的肃王府内新建敬依仓。甘肃仓、预备仓和草场隶属甘肃镇和陕西行都司支配，敬依仓则专供肃王府使用。其中的甘肃仓，就是保留至今的国家级文物保护单位——张掖明粮仓。（张鸿清）